>>90
1.まず色塗り用レイヤーと線画レイヤーを分けて、色塗り用レイヤーを選択
2.バケツツールの設定(ツールオプション)を開いて、複数参照にチェックを入れ「すべてのレイヤー」を選択
3.続いて「領域を拡縮」にチェックを入れ、さらにその右側の「最も濃いピクセルまで拡張」を選択
4.合わせて「ベクター中心線まで塗る」も選択

これで恐らく、今まで余白が残っていた部分まで塗ることができるかと思います