マジレスすると普通ソフトによって異なるので何とも
Photoshopの場合はjpgで保存の際には圧縮画質の品質選択が出てくる
iPadのプロクリエイトの場合はフォーマットの選択以外何もできない
jpg変換ツールとか使ってるならそのツールの設定項目の中にないなら他の手段使うしかないと思う