/etc/login.confに、

# for limiting www user
www:\
<TAB>:cputime=60:\
<TAB>:tc=default:

を足して、

cap_mkdb /etc/login.conf

を実行し、

apache2limits_enable="YES"
apache2limits_args="-e -C www"

を/etc/rc.confに設定して、apacheをrestartした。