datのレス数とsubject.txtのレス数が違っていた場合に、スレに
書き込んだ時の、subject.txtのレス数の処理はどうなっていますか。

通常のbbs.cgiでは、subject.txtのレス数に関わり無く、書き込む度に
datからレス数を数え、その数をsubject.txtに書き込んでいた為、
subject.txtのレス数が異常でも、そのスレに書き込めば直ったのですが。

というか、これ。
http://live22x.2ch.net/test/read.cgi/eq/1136722083/
subject.txtのレス数がdatより1多い状態になっているのですが、
スレに書き込んでも、subject.txtのレス数がそのまま+1されるだけの
ようで、はて、どうしたものかと。

通常の板復帰では、subject.txtに載っているスレは、レス数を数えて
直してはくれないはずですし。
古い完全復帰なら直してくれた気はするけど、どうだったかな。