指摘もらった内容で flock 使わないダミーファイル&rename方式で作り直してみました。
http://choco.tank.jp/trac/wiki/subjectTxtFunc (説明)
http://choco.tank.jp/trac/browser/trunk/perlre/SUBJECT_TXT/func2.pl (ソース)

今回は subject.txt の更新だけなので、index.html subback.html の話は別に