http://qb5.2ch.net/test/read.cgi/operate/1171963749/906
にあるアトミックとは、ファイル更新時のデータの一時的な乱れや
http://ex20.2ch.net/test/read.cgi/nanmin/1170905254/732-740
で雑談で出たファイルの不整合のことだと思いますが、

私の認識では、プロセスの排他制御を行い同一リソースに対する
デッドロックさせない、同時に書き換えさせずに不整合を生まない
という意味での掲示板全体のアトミックを考えてました。

>>862の説明ページにも書いてありますが、プロセス間の排他制御を行わない
ダミーファイル方式の場合、bbs.cgi のプロセス切り替えが発生した場合、
実際の dat レス数と subject.txt の不整合が生じます。
(これも書いてありますが、同じスレで発言があれば治ります)
また、age 書き込みしたのにあがらない(saborin ではない)ことも発生します。
この程度は利用上の致命的問題とならないので現状でもＯＫなんだと思います。

このあたりの考え方は技術者的思考＆嗜好ですみません