>>860
再利用となる index.html や subback.html 作成用の subject.txt データに関しては、
bbs.cgi で subject.txt を更新(func.pl の UpdateSubjectDat())した後に

open(SUBJECT, $subjectTxtPath)
　　binmode(SUBJECT);
flock(SUBJECT, 1);
@subjectTxt = <SUBJECT>;
close(SUBJECT);
chomp(@subjectTxt);

で改めて読み込んで処理すればいいかと。
@subjectTxt = <SUBJECT>; な読み込みは Perl 内部で特に最適化されてる部分なので
二重の読み込み処理に見えますが、そんなにコストは高くないです。