原因のひとつであることは間違い無いけれど、主原因なんですかね?
このグラフですが、元ネタは何でしょう?
Load Average の1分値を100倍した数字でしょうか?
OSによってLoad Averageの測り方は全然違いますが、何でしょ?

とりあえず、全般にレスポンスタイムが悪くなってプロセスが溜まり込んだところで
>>438のスレが最後のひと押しをしたんじゃないかなあ、という印象ですが。

iostatの拡張オプションでディスクアクセスの所要時間を記録してたりとかいうことは無いですかね。