でも、板を減らして負荷を下げるとおさまる。
ということはサーバ固有なものであり、負荷によって変わるものが原因か、

その間 CPUは暇している、DISKi/o も天井まではまだ余裕があるようだ

NIC 、 スイッチ、 等々の場合人によって変わるとか他のサーバは問題ないとか
なので主原因ではないと思う。

一番あやしいのは、やっぱサーバの設定でしょうねぇ