ぷろじぇくと ぞうさん95日目で、ブートで('A`)になってる問題で、
HDDパーティション管理"GPT"も絡んでるかもしれないですね。
GPTについては↓のところを参照下さい。
ttp://wiki.nothing.sh/page/Over2TB

さて、GPTでブートするにはEFIがないと起動ができません。
現在DOS/VでEFIを表明しているのは極一部です、APPLE、MSIそしてINTELの純正MBです。

('A`)さんの問題切り分けとして、HDDの"GPT"を徹底的に避けてみてはどうでしょうか。
(やたらGPTに恵まれてる環境ですし)
・BIOSで"UEFI"(が存在したら)を無効にする。(現在所有しているのDG45IDというINTELMBではBIOS設定の中に"UEFI"という項目があります)
・XPなどGPT未対応OSで全PTを削除後し、何かしらのPTを作成しておく(旧MBRを作る)
・Linux再インストール時に"GPT"について目を光らせながらインストール。

2TBOK,PTテーブル二重化による堅牢性、基本PTは128個まで作り放題など
GPTの長所は多数ありますが、起動HDDの用途ではまだ適していないようです。

<チラ裏>
さてこのGPT、UFIと呼ばれるファームウェア(MACとか)でないと起動できないはずですが、
私のThinkpad X61に、OpenSUSE11.1をGPTで設定しても起動できてしまいました。
ウホ、EFIじゃなくてもGPTで起動→IYHAaaa→と思ったのですが、
OpenSUSEがGPT設定と同時に旧"MBR"にも書いてくれたおり、単にMBRから起動していただけでしたorz。
こんな風にGPTでありながらとMBRが使えるするOSもいますので注意してください.
</チラ裏>

以上、スレ汚し失礼しました。

それでもダメなら徹底的にGPT方向へ、はわわ