あれ、
> 前回のセットアップは、sysinstallで取ってきたソースにパッチをあてて使用しましたが、

この「パッチ」って、ひょっとして SA にあった(ここの過去スレにあった)やつですかね。

それだけだと不十分なので、日記にあるようにcsup
(最近のFreeBSDはcvsup入れなくてもcsupが標準です)でとってきて、それに対して
作業するのがいいと思いますです。
というかこれまで(今までのmaido3.comなサーバ)は、それでやってきたのでは、と。