http://【qb5.2ch.net:80】/test/read.cgi/operate/1279884853/

この【】で囲った部分がauthorityと呼ばれるところ
そしてauthorityにはhostが存在する(この場合qb5.2ch.net)
hostの形式はIP-literal / IPv4address / reg-name
このうちreg-nameでは*( unreserved / pct-encoded / sub-delims )
という形式が認められている

つまりホストをパーセントエンコーディングで指定する>>399
正式な表記であるということ

>>418
ブラウザか専ブラのどっちが.comを付けているのか知らんが、
いずれにせよ間違った挙動であることは確実