ガイドライン６理由で削除される事になるのか、という意味での質問なら、
答えは基本的にはNO。極稀に、乱立理由で処理される事が無いでもないが、稀。

ただし、その板に沿った内容で話題が展開していない場合、板違いとして
処理される事になる場合は無論ある。

ローカルルール的な話をするなら、特定のスレが削除ガイドラインに基づいた場合は
板違いになるという事がはっきりしている場合、案内目的などでその事を
明記するようにするというのは、ある種本来のローカルルールの使い方ですらある。
とはいえ、新板設立などで、「新しく板違いと判断される状況が発生した」ような場合は、
ガイドライン（及び、実際に行われた削除処理）を根拠に、強硬に話を進めようとすると、
かえって議論がこじれてまとまらなくなったりするので、その辺りはある程度の
移行期間を設けるなど、譲歩もした方がいいだろう。