うーん、やっぱ変ですよ。
運営カテゴリだけスレストする合理的な理由がないし。

＞あえて削除する理由
スレッド一覧、過去ログ倉庫の見易さという点。

他の板では普通にスレッド削除は行われてるのに、運営カテゴリではほとんど行われていない。
あえて削除する理由がないなら、全板で削除禁止、スレストにすればいいと思います。