本人に聞きゃいいじゃん…
と言おうと思ったけどさすがに意地悪かな

雲の形ならクリスタでそういうブラシがある・配布されてるし
塗りならグリザイユでざっくり形取ってカラーレイヤーとオーバーレイレイヤーで色乗せるか
丸ペンとかでベースの色の形取ってレイヤーで選択範囲取るかクリッピングするかして乗算やスクリーンで影や光入れるか…かな？