自鯖の OS を入れ替えたと同時に perl が 5.6.2 から 5.8.2 になったのですが、
perl で動いているものすべて、メモリの使用量が、おおかた 1/3程度にまでに減りました。@ top とか ps とかで確認。
もしかすると perl5.8 系を導入すると、メモリ周りの窮屈さが解消されるかもしれないです。
(最新は 5.8.5 )
ただし、カーネル周りも入れ替わったせいか、 LA はちょっと増加。。。

ちなみに、Shift_JIS で描かれていたものでも今のところ不具合無く動いております。